Các nhà nghiên cứu tại Tổ chức Nghiên cứu Công nghiệp và Khoa học Khối thịnh vượng chung (CSIRO) đã phát triển một nền tảng hình ảnh hóa mới, được củn g cố bởi các thuật toán tin sinh học ban đầu được sử dụng để phân tích bộ gen người, để xác định sự khác biệt giữa hàng nghìn trình tự di truyền của SARS -CoV-2, một loại coronavirus mới gây ra bệnh COVID-19.

Cấu trúc của coronavirus. Credit: Scientificanimations.com / CC BY-SA 4.0.

Tiến sĩ Larry Marshall, Giám đốc điều hành của CSIRO cho biết: “Chúng ta càng biết nhiều về loại virus này, thì chúng ta càng có vũ trang tốt hơn để chống lại nó.

“Việc phân tích trình tự gen của vi rút SARS-CoV-2 rất phức tạp này đã giúp xác định chủng vi rút nào phù hợp để thử nghiệm vắc xin đang được tiến hành tại Trung tâm Chuẩn bị sẵn sàng Dịch bệnh Úc ở Geelong, cơ sở kiểm soát sinh học cao duy nhất của nó tử tế ở Nam bán cầu ”.

Tiến sĩ Denis Bauer, trưởng nhóm tin sinh học của CSIRO và là nhà nghiên cứu tại Đại học Macquarie cho biết: “Khi virus phát triển, bộ gen ngày càng trở nên quan trọng, hiệu quả vì nó nắm giữ các chỉ dẫn về hành vi của virus và loại bệnh mà nó có thể gây ra.

“Trên toàn cầu hiện có một lượng lớn các chuỗi virus riêng lẻ. Đánh giá khoảng cách tiến hóa giữa các điểm dữ liệu này và hình dung nó giúp các nhà nghiên cứu tìm hiểu về các chủng vi rút khác nhau – bao gồm cả nguồn gốc của chúng và cách chúng tiếp tục phát triển. ”

Hiểu được trình tự bộ gen giúp các nhà nghiên cứu chọn đúng chủng vi rút SARS-CoV-2 cho các nỗ lực chẩn đoán và vắc xin. Credit: CSIRO.

181 bộ gen SARS-CoV-2 được công bố đầu tiên đã được phân tích để hiểu những thay đổi trong virus có thể ảnh hưởng đến hành vi và tác động của nó như thế nào.

Giáo sư SS Vasan, trưởng nhóm các mầm bệnh nguy hiểm của CSIRO và một nhà nghiên cứu tại Đại học York, cho biết: “Loại virus RNA này dự kiến ​​sẽ phát triển thành một số cụm riêng biệt có chung đột biến, đó là những gì chúng tôi đã xác nhận và hình dung.

“Tại thời điểm này, chúng tôi không cho rằng nó sẽ ảnh hưởng đến việc phát triển và đánh giá vắc-xin, liệu pháp và chẩn đoán COVID-19, nhưng đó là thông tin quan trọng cần theo dõi khi các nghiên cứu tiền lâm sàng và lâm sàng đang tiến triển”.

“Để thực hiện điều này, chúng tôi kêu gọi cộng đồng nghiên cứu quốc tế chia sẻ thông tin chi tiết chưa được xác định về mức độ nghiêm trọng và kết quả của ca bệnh cũng như các siêu dữ liệu liên quan khác như bệnh đồng mắc và tình trạng hút thuốc, cùng với trình tự gen của vi rút.”

Nghiên cứu này cho thấy tầm quan trọng của sự hợp tác chéo giữa các ngành tin sinh học, gen, tiêm chủng và virus học đã và mới được thành lập.

Tiến sĩ David Hansen, Giám đốc điều hành Trung tâm Nghiên cứu Sức khỏe Điện tử Úc của CSIRO cho biết: “Việc tuân theo quy trình khoa học của ấn phẩm mở được bình duyệt như bài báo này là một thành phần cực kỳ quan trọng trong phản ứng của CSIRO.

Bài của nhóm báo đã được xuất bản trên tạp chí Transboundary and Emerging Diseases.

_____

Denis C. Bauer và cộng sự. Hỗ trợ đối phó với đại dịch bằng cách sử dụng gen và tin sinh học: một nghiên cứu điển hình về đợt bùng phát SARS-CoV-2 đang nổi lên. Các bệnh xuyên biên giới và mới nổi, được công bố trực tuyến ngày 19 tháng 4 năm 2020; doi: 10.1111 / tbed.13588

Bài viết này dựa trên văn bản do CSIRO cung cấp.

Nguồn: sci-news