Một phân tích và mô hình cấu trúc của protein đột biến SARS-CoV-2, khu vực của virus tạo điều kiện xâm nhập vào tế bào, cho thấy một tính năng độc đáo có thể giải thích tại sao COVID-Virus coronavirus 19 có thể lây truyền giữa người với người. Nghiên cứu cũng chỉ ra rằng, ngoài các loài linh trưởng, mèo, chồn và chồn hương là những loài động vật có vẻ dễ bị nhiễm virus SARS-CoV-2 nhất.
Hình ảnh hiển vi điện tử quét màu của một tế bào apoptotic (màu đỏ) bị nhiễm các phần tử virus SARS-COV-2 (màu vàng), được phân lập từ mẫu bệnh phẩm. Credit: NIAID.
Trong nghiên cứu, Giáo sư Gary Whittaker từ Khoa Vi sinh & Miễn dịch học tại Đại học Cornell và các đồng nghiệp đã xác định được một vòng cấu trúc trong protein đột biến SARS-CoV-2 và một chuỗi bốn axit amin trong vòng này khác với các coronavirus người đã biết khác.
Phân tích dòng dõi của SARS-CoV-2 cho thấy nó có chung các đặc tính của SARS-CoV-1 có liên quan chặt chẽ, xuất hiện lần đầu ở người vào năm 2003 và có khả năng gây chết người nhưng không lây lan cao, và HCoV-HKU1, một chất có khả năng lây truyền cao nhưng tương đối coronavirus ở người lành tính.
“Nó có sự kết hợp kỳ lạ của cả hai thuộc tính này,” Giáo sư Whittaker nói. “Dự đoán là vòng lặp rất quan trọng đối với khả năng truyền tải hoặc tính ổn định, hoặc cả hai.” “Chúng tôi đang tập trung vào nghiên cứu sâu hơn về vòng cấu trúc này và trình tự của bốn axit amin.”
Các vị trí kích hoạt của SARS-CoV-2 S1 / S2 và S2 ‘. Các vị trí kích hoạt S1 / S2 và S2 ‘của các kiểu SARS-CoV-1 và SARSCoV-2 S được hiển thị trong chế độ xem bề mặt và dải băng. Các vị trí S1/ S2 và S2 ‘của bat-CoV được hiển thị trong dạng xem dải băng. Sự tương đồng của axit amin với SARS-CoV-1 được ghi nhận như sau: Vị trí S1 / S2 – tương đồng (đỏ) và khác biệt (xanh lam); Vị trí S2 ‘- tương đồng (vàng) và khác biệt (đỏ tươi). Sự liên kết axit amin của các vị trí S1 / S2 và S2 ‘được hiển thị, và sự tương đồng cũng được ghi nhận. Credit: Jaimes et al, doi: 10.1016 / j.jmb.2020.04.009.
Theo nhóm nghiên cứu, mèo, chồn và chồn cũng dễ mắc bệnh. Để lây nhiễm tế bào, các đặc điểm của protein đột biến phải liên kết với thụ thể trên bề mặt tế bào vật chủ và mèo có vị trí liên kết thụ thể gần giống với người. Cho đến nay, nhiễm trùng ở mèo dường như nhẹ và không thường xuyên, và không có bằng chứng cho thấy mèo có thể lây nhiễm sang người.
“Các cuộc điều tra về coronavirus ở mèo có thể cung cấp thêm manh mối về SARS-CoV-2 và coronavirus nói chung,” Giáo sư Whittaker nói. “Chúng tôi đang giữ một tư tưởng cởi mở để xem liệu những điều tương tự có thể xảy ra ở mèo mà hiện nay đang xảy ra ở người hay không.”
_____
Javier A. Jaimes và cộng sự. Phân tích Phylogenetic và Mô hình Cấu trúc của Protein Spike SARS-CoV-2 Tiết lộ Vòng lặp kích hoạt nhạy cảm về mặt tiến hóa và phân biệt về mặt protein. Tạp chí Sinh học Phân tử, xuất bản trực tuyến ngày 19 tháng 4 năm 2020; doi: 10.1016 / j.jmb.2020.04.009
Bài viết này dựa trên văn bản được cung cấp bởi Đại học Cornell.
Nguồn: sci-news